Panjang lunasnya ialah 17,29 m dan lambungnya sekitar 19 m (secara keseluruhan) dengan lebar 4,25 m dan tinggi lambung 2,25 m. Dalam sarat air semasa belayar ialah sekitar 1,5 m. Kapal ini didorong oleh dua layar tanja' ("layar persegi panjang yang condong"). Papan lambung dibuat dari bungur (kadang disebut "benteak") dan deknya diperbuat dari kayu jati.[1] Rekonstruksi kapal Borobudur tidak dibina dengan perisai tinggi di haluan dan buritan seperti di relief kerana mereka menghalangi pandangan sejauh yang melanggar Peraturan untuk Pencegahan Perlanggaran di Laut.[2]